祝由术是非常古老的一种异术，从黄帝时期就传了下来，但在元朝的时候，却被蒙古族的萨满教视作劲敌，从而受到打压驱逐，几近殆尽。

当时的萨满教也不叫萨满教，只不过是一些乌合之众，由于当时蒙古铁骑几乎征服了半个世界，所以就算祝由术厉害，终归还是没能敌得过萨满教。

萨满教也是从那个时候开始，吸收了祝由的精髓，所以后来才会衍化成满清政府时期的萨满教。而祝由术逐渐淡出历史舞台，也是从那个差点儿亡国灭种的时代开始的。