在明孝陵隆重祭祀了明太祖朱元璋之后，朱由榔便下令将行在由衡州迁往应天府（南京），随之整个朝廷开始了大迁移。

而张名振见鲁王受到了朱由榔的最高礼遇之后也彻底放下心来，他带领着家属前往南京朝见朱由榔，朱由榔于是在封赏功臣的时候对鲁王所部的功臣也一律加以封赏。

郑成功也将自己的儿子郑经以及妻子还有其他亲属全部送来了南京以此来表示对朱由榔的忠诚，可以说南明内部最强大的两股势力先后都真心归顺了朱由榔。