朱由崧在洛阳蓄力的同时，一场大戏在北京开演了。

万历四十五年正月十一日，朝廷各衙门尚未开衙办事，首辅方从哲便上疏万历建议丁巳京察于正月二十八日和二月二日分两期举行，但万历似乎已经从福王府左长史闫文清的案子中嗅到了党争的气味，将方从哲的奏疏留中不发。

迟迟得不到万历皇帝的回复，正月十五日，心急如焚的方从哲便再次上疏，以京察日期未定为由再次奏请前疏，但万历皇帝依旧留中不覆。