他母亲是万历皇帝最宠爱的郑贵妃，而朱由检、朱由校的父亲朱常洛是万历皇帝的长子。

万历皇帝宠爱郑贵妃，想废长立幼，被众大臣极力反对，引发了国本之争。

围绕着谁当皇帝这个问题，大臣们与皇帝斗了15年，国本之争成了万历朝最激烈复杂的政治事件，逼退首辅四人，部级官员十余人、涉及京城及地方官员人数三百多位，其中一百多人被罢官、解职、发配，直接导致万历皇帝不上朝以示抗议。