朱由检认为，大明的弊病，就在于朝中没有能够制约各方力量的存在，让这些人肆无忌惮。

他要从根源上，改革朝廷的结构和制度，将文官集团纳入统辖范围之内，使文官集团能够为朝廷服务。

朱由检的想法是：

首先，他要废掉太学。

太学里面教授的，是儒家学说，不能让儒家传承断了。

然后，再取消科举考试，禁止士绅捐官。这是为了减少士绅参与选官之权。而后，就是废除宦官。