在伊贺，有一座行基开设的叫伊贺四十九院的寺院，里面以供奉着弥勒菩萨的本堂为中心，周围围着四十九间山伏房，从建立开始，便是传授给弟子各种忍术、技法的地方。

伊贺四十九院，可以说是伊贺忍者们的发源地及圣地。

随着岁月流转，时局动荡，伊贺流同样经历着起于微末，发展，鼎盛及衰败的过程。

或许，一切都是天意。

就在一个阴郁的雷雨天气，几道紫色的闪电正巧劈中伊贺四十九院中的一间山伏房，继而引发大火。