江淮及南方各地的这一场梅雨紧接着春末的雨水而来，导致寻常一个月便会结束的梅雨期持续了两个月又半，直到六月中旬才“出梅”。

这期间，江南地区天气一直阴雨连绵，并不时有大雨、暴雨出现，加上持续时间极长，短短两个月半的雨水，便已达寻常年份一整年的降水，以致江淮与南方各地山洪决堤，泛滥成灾。

洪水冲毁房屋，百姓流离失所，良田被毁，粮食短缺，又因雨水持续不停，道路河道被冲毁又无法及时修整，即便京城有囤粮，也无法输送到江南各地，粮荒加剧，伴随疟疾而来，江淮及南方各地陷入了前所未有的混乱之中，燕国庙堂迎来了百年一遇的难题。