但是洪武元年至洪武四年这期间，以李善长为首的淮西集团权力过分膨胀，从而导致皇权与相权的矛盾逐渐激化。

朱元璋那时便对李善长愈发不满。

因此在洪武四年，李善长因长期患病在家休息很多天，没有能够前往中书省处理政事，心中倍感不安，于是上疏恳请致仕，也就是退休。

其实李善长当时这样做的目的有两个。

其一，为了向朱元璋表示自己未能尽职，而有愧于朱元璋的信任。