按照吴又可提出的防疫方略，开封等地，当立即依京城成例，将已发现病例的街坊、村落全部划为疫区，严密封锁，许进不许出。

于城外空旷通风处，搭建大批简易窝棚，作为集中隔离病坊，所有确诊及高度疑似患者，一律强制移送至此，由医官集中诊治、照料。

病坊分区管理，重症、轻症、疑似分置，严防交叉感染。

另外，官府还要征调全城衙役、警察、民壮、兵丁，组成消杀队，由医学院学员指导，每日用石灰水泼洒疫区及主要街道、水井、沟渠。