因为随着军士频繁征调和吏治日益腐坏，各级卫所军官们开始肆无忌惮地侵占卫所田地，强迫军户为自家无偿劳作，日积月累之下屯田黄册变得形同虚设，而普通军户事实上沦为了将领们的农奴。

其后果就是“屯田籽粒”越来越少，军户对朝廷渐渐离心离德，那支从军户子弟中选拔出来的、曾经战无不胜的明军，也由此堕落为一支不堪一击的弱旅。