王彪之还曾针对官员太多而且升迁不按规定的问题，提出减省一些虚职并进行效能考察的建议，这恐怕就有点招人恨了，毕竟影响到了一部分人的利益。

尤其是王彪之不畏强权，除了永和七年帮助朝廷劝退桓温率军进逼建康，升平二年（358年）王彪之还劝阻了司马昱以桓温之弟桓云接任豫州刺史的计划，防止桓家势力进一步壮大。后果，自然是将自己置于桓温的对立面，引起桓温的忌恨。