西晋灭吴，收编了孙吴水军，使西晋的水军更加强大。

东晋建立后，偏安长江以南地区。在东晋末年，政治黑暗，人民水深火热。权臣司马元显把持朝政。为实现其政治野心，司马元显建立私属军队，强征会稽、吴、吴兴等沿海诸郡的农民当兵，名曰“乐屋”。此举使“东土嚣然，人不堪命，天下苦之矣”。司马元显强征“乐屋”导致了东晋末年孙恩、卢循起事。