清查令下发全国各府州县。

朱和壁在文华殿召集吏部、刑部、都察院的主官，布置了清查的具体细则。

细则规定：凡近二十年内被贬谪、流放、革职的官员，逐一核查其案卷，查实有无冤情，有无家属下落不明，有无可能勾结乱党。

清查结果每两个月汇总一次，上报内阁。

各地知府、知县接到清查令后，不敢怠慢，纷纷翻箱倒柜，把积压多年的旧案卷宗搬出来一一核对。