但也正是在这一年，一次研究新型纳米机器人.赤潮1.0型时，发生了不可控制的危机事件，整个研究所被废弃封闭，失控的纳米机器人在无限分裂之中，转变成了各种各样的机器怪兽。同时，就在纳米危机爆发的时候，一支虫群舰队入侵了苍蓝星，并释放出了远远超出苍蓝星驻军对抗能力的庞大登陆部队。

为了避免不可挽回的损失，苍蓝星总军区指挥部下达了“大撤退”的命令，在驻军的掩护下，所有被紧急动员起来的星舰，无论军用还是民用，都承担起了支援撤离的任务。而不幸中的大幸，算上愿意撤离的原住民在内，需要撤出的人员远远低于撤离舰的运载上限，大撤退进行得很顺利。