魏忠贤呈报：“据供词，天机阁原为南直书院清谈之社，后被逆党所用，密谋推举新主，以复所谓士人正统。”

黄道周听罢，不由冷汗涔涔。

朱由检冷笑一声：“书生误国，不输鞑虏。”随即钦定：“天机阁为逆党，凡涉足者，轻则充军，重则抄家，主谋者凌迟枭首。”

一时之间，京中风声鹤唳，士林缄口，文馆悄然遣散一批学士。太学更罢免十名讲官，另选忠勇之家子弟任之。