顺治三年，博洛被清廷正式任命为征南大将军，同固山额真图赖率领大军南下，全权负责进攻浙江、福建等地的军务。博洛率领满洲八旗主力抵达南京之后，原平南大将军、贝勒勒克德浑与他完成了东南军务的交接，便带着自己的本部兵马返回北京休整。

接手东南军务之后，博洛立刻着手整顿兵马，收编了大量明朝的降兵降将，兵力迅速扩充。准备妥当之后，他兵分两路，大举进攻浙东：一路由主力马步兵组成，从杭州六和塔、富阳、严州一线涉水渡过钱塘江，从正面发起进攻；另一路则是水师部队，从鳖子门沿海岸线全线出击，配合陆路部队夹击明军。