东南海上，靖海伯俞大猷因捣毁巨寇郑万春巢穴、截获违禁军资、揭发逆党阴谋之功，晋封靖海侯，仍总督浙直福建等处军务，权势更隆。其麾下胡守仁、卢镗、戚继光等将领各有封赏。更重要的是，经此一役，朝廷对东南海防的重视与投入达到空前，水师战船得以增补修缮，沿海卫所兵员、粮饷得到一定充实，海禁政策虽未明言大开，但对“剿抚并用”、“以盗制盗”、“有限开海”的讨论，已开始在朝堂之上悄然萌发。那个名叫沈致远的年轻锦衣卫，其潜入贼巢、传递情报、协助破贼的事迹，也在一定范围内流传，成为军中风闻的传奇，他本人被擢升为百户，留于俞大猷军中听用，戴罪图功（出逃卫所之过被功抵）。