当时他的行为做派，和整个清朝末年官场上的那些固有的作风，尤其是山高皇帝远的西北地区，各个衙门口官老爷的做派，形成了非常大的反差。

很快的，马抱山就和塞北府布政司的一些官员们发生了很大的冲突。志不同道不合，最后马抱山愤然离开了布政司回到了河州府。河州府当时是归塞北府布政司管辖的，既然在上级单位的衙门口离职，回到这些地方衙门，那些地方的知府老爷，当然没有一个人敢挽留他在衙门口当差。更不会轻易的听从他那些所谓的合理化建议，和“改变军队落后现状”的思路。