再加上崇祯帝生性多疑，用人不专，今天提拔明天贬黜，根本没心思去管一个没名气的手艺人。

薄珏对此却毫不在意。他本来就不想做官，早就看透了官场的乌烟瘴气。见朝廷不用，他便向张国维辞行，要回苏州老家。张国维再三挽留，又赠给他许多金银绸缎，薄珏都婉言谢绝了，只带走了自己的工具和图纸。

回到苏州之后，薄珏依旧过着清贫的日子，继续钻研他的机械与天文。明朝灭亡后，他隐居乡里，拒不仕清，整日埋头于作坊之中。晚年的他积劳成疾，又加上战乱流离，生活困顿，最终病死在了家中。